تعمل المنظمة وفق النظام الداخلي والهيكل التنظيمي وكما يلي : رئيسة المنظمة :
وهي المسؤولة عن ادارة وتنظيم ومتابعة عمل المنظمة وتوجيه سياستها وتمثيلها في الدوائر الرسمية وشبه الرسمية ولدى الهيئات الأخرى وطنيا ودوليا كما تقوم بالأشراف على لجان المنظمة المختلفة.
مجلس الادارة :
يتكون من ثلائون عضوة ينتخبون من قبل الهيئة العامة وذلك عند أنعقاد مؤتمرها العام كل ثلاث سنوات وبالأقتراع السري ويضم ( الرئيسة والنائبة , ١٠ عضوات الهيئة التنفيذية ، ١٨ مديرة مكاتب المحافظات والفروع ).
الهيئة التنفيذية :
١- نائبة الرئيسة
٢- أمينة السر
٣- المقررة العامة
٤- مسؤولة الشؤون الأدارية
٥- مسؤولة الشؤون المالية
٦- مسؤولة الشؤون الثقافية
٧- مسؤولة الشؤون القانونية
٨- مسؤولة المتابعة والتنسيق
٩- مسؤولة البحوث والدراسات
١٠- مسؤولة العلاقات العامة والأعلام
١١- مسؤولة اللجان والمراكز
اللجان والمراكز المرتبطة بالمنظمة :
١- مركز البحوث والدراسات
٢- لجنة التنمية المستدامة
٣- لجنة المشاريع والتنفيذ
٤- لجنة الندوات والمؤتمرات
٥- مركز تطوير النساء والأطفال في الأرياف
الأقسام :
١- قسم الادارة العامة: يتولى متابعة الشؤون الأدارية والمراسلات وتشرف عليها مسؤولة القسم .
٢- قسم الشؤون المالية: يتولى ادارة الشؤون المالية والحسابات وتوثيق المنح والمساعدات وتنظيمها .
٣- قسم الشؤون القانونية: يتولى الأشراف على الشؤون القانونية ومتابعة القضايا المتعلقة بالمنظمة قانونيا .
٤- قسم الشؤون الأعلامية: يتولى متابعة شؤون الأعلام والنشر وأصدار المنشورات والدوريات ومتابعتها.
٥- قسم العلاقات العامة: ينظم عمل العلاقات الوطنية والدولية وتنسيقها .
المكاتب والفروع :
١- تكون مديرة مكتب المنظمة في المحافظة اوالفرع عضوآ في مجلس الادارة .
٢- تشكل هيئة ادارية في كل محافظة ترئسها مديرة مكتب المحافظة وتتمتع بكافة صلاحيات المركز العام وتعمل لامركزيآ وترتبط اداريا بالمركز العام .
