يتطلع المعهد بالمهام التالية

‌أ) وضع وتنسيق الأنشطة التي يقوم بها الطرفان المتعاقدان وما يقومان به مع طرف ثالث؛

‌ب) المساعدة في صياغة مواقف مشتركة للدول الأفريقية والعربية حول المسائل المتعلقة بالبرنامج الثقافي؛

‌ج) إجراء أبحاث ودراسات عن العلاقات العربية – الإفريقية والقيم الثقافية بما يبرز عزة الإنسان الأفريقي والعربي وإسهامهما في بناء الحضارة الإنسانية

‌د) تشجيع الأبحاث والدراسات الخاصة بالمبادلات الثقافية والتنمية الاجتماعية الثقافية بين العالمين الإفريقي والعربي؛

‌ه) الحث على إنشاء مراكز أبحاث ومراكز ثقافة إفريقية عربية؛

‌و) تنسيق الأنشطة التي تقوم بها هذه المراكز، وجمع ونشر المعلومات والوسائل اللازمة لتشغيلها، والاهتمام بتدريب العاملين المطلوبين؛

‌ز) السعي إلى جمع وحماية واستغلال التراث الثقافي المشترك بالخصوص المخطوطات والمباني الأثرية والفنون والآثار التاريخية ..إلخ والعمل على استعادة الكنوز الثقافية التي نهبت من أفريقيا والعالم العربي؛

‌ح) تنظيم ندوات ومؤتمرات ومهرجانات تكون ملتقى لرجال الثقافة والعلم والشبان ورجال الجامعات، والقيام بنشر الأعمال التي تسفر عنها هذه اللقاءات؛

‌ط) تنظيم مسابقات ومنح جوائز وتقديم منح لإذكاء التنافس بين رجال الثقافة والعلماء والشبان والرياضيين والنساء...إلخ؛

‌ي) تنظيم زيارات متبادلة للشباب والفنيين والرياضيين والنساء ...إلخ؛

‌ك) تنظيم تبادل الأساتذة والطلاب ووضع برامج للمبادلات الثقافية؛

‌ل) تنظيم دورات تدريبية مشتركة للكوادر العربية والإفريقية؛

‌م) طبع ونشر الإنتاج الفكري والأدبي والفني العربي-الأفريقي؛

‌ن) إعداد موسوعة عربية إفريقية؛

‌س) تأليف معاجم عربية إفريقية؛

‌ع) الإسهام في طبع ونشر كتب مدرسة، وجامعية وكتب للثقافة العامة تكون في متناول الجميع وتقترحها الدول في إطار التعاون الإفريقي العربي والسعي إلى تحقيق الانسجام في مضمونها.

‌ف) الإسهام في ترجمة أفضل المؤلفات العربية والإفريقية من لغاتها الأصلية.

‌ص) البحث عن الموارد الإضافية لحماية واستغلال الثقافة الأفريقية العربية؛

‌ق) القيام بجميع المهام تم تحديدها بموجب نصوص النظام الحالي وما تحدده قرارات المجلس التنفيذي.