إن تخطيط وتنسيق وتنفيذ ورقابة أعمال المنظمة ونشاطاتها تقوم بها أجهزة المنظمة الإدارية كل في مجال اختصاصه ومسئولياته وفقاً للنظام الهرمي الآتي :

أ‌) مجلس الأمناء :
 ويتكون هذا المجلس من أربعين عضواً يمثلون الأجهزة الحكومية المختصة والجامعات والمؤسسات العلمية والقطاع الخاص والشخصيات العامة ذات المبادرات والعطاء في التنمية الاجتماعية.  ويختص هذا المجلس ب :-
١- إجازة السياسات العامة والخطط والبرامج وموجهات الميزانية واللوائح الداخلية.
٢- إجازة التقارير السنوية عن أداء المنظمة والتقارير المالية.
٣- تعيين مجلس إدارة المنظمة وفقاً للنظام الأساسي.
٤- ترقية ونشر فكر التعليم المفتوح واستخدام الوسائل الإعلامية وغيرها لتحقيق ذلك.

ب‌) مجلس إدارة المنظمة :
 يتكون هذا المجلس من أربعة عشر عضواً يعينهم مجلس الأمناء يمثلون الأجهزة الحكومية المختصة، والشخصيات ذات الاختصاص والخبرة في مجالات تنمية المجتمع والتعليم والعمل الطوعي ويكون المدير التنفيذي عضواً يحكم منصبه.  ويختص المجلس بـ :-
١- إعداد السياسات والخطط والبرامج التفصيلية للمنظمة.
٢- يرفع تقريراً سنوياً لمجلس الأمناء عن سياسات وخطط المنظمة.
٣- إعداد الميزانية العامة وتقارير الأداء المالي ويرفع توصياته لمجلس الأمناء.
٤- يعين المدير التنفيذي ويقر شروط خدمة العاملين بما يتماشى وقانون العمل.
٥- يسعى لترقية مستوى العمل بالمنظمة وتحقيق برامجها وأهدافها.

ج‌) الإدارة التنفيذية :
 وهو الجهاز الإداري المسئول مباشرة عن نشاطات وعمل المنظمة في التخطيط والتنفيذ والرقابة والمتابعة، ويؤدي العمليات الإدارية والمالية، وينفذ البرامج على أرض الواقع، ويقوم بالبحوث وبجمع المعلومات وتحليلها وتقييم وتقويم الأداء وكتابة التقارير ورفعها للجهات والأجهزة المختصة، ويبرم العقود والاتفاقيات الخ... ويعمل هذا الجهاز تحت قيادة مدير تنفيذي مقتدر.
تتكون الإدارة التنفيذية بجانب المدير التنفيذي من : 
ستة مساعدين مسئولين عن الإدارات المختصة الآتية :
١- البرامج
٢- الإدارة
٣- الشئون المالية
٤- التحرير والنشر والمعلومات
٥- المكاتب الإقليمية والولائية
٦- المطبعة
 مديري المشروعات والمنسقين المسئولين مباشرة عن تنفيذ المشروعات.
 المكاتب الإقليمية والولائية التي تسهل التنفيذ والرقابة والمتابعة.
 عدد من الموظفين الدائمين والمؤقتين وفقاً لمقتضيات واحتياجات العمل.