تهتم منظمة شباب الجنوب بتنفيذ بعض البرامج في مجالات:

قيم ومباءىء حقوق الإنسان والديمقراطية.
تمكين و تقوية المنظمات والجمعيات غير حكومية.
تمكين الأحزاب والتيارات السياسية.
حل وإدارة النزاعات.
نبذ العنف ضد المرأة.
توزيع المساعدات العاجلة للمتضررين.