تقوم الجمعية الملكية لحماية البيئة البحرية بتحقيق أهدافها من خلال:
١- استقطاب أصحاب الاهتمام والمختصين في مجالات البيئة، وتهيئة المناخ الملائم لممارسة نشاطاتهم بما يحقق أهداف الجمعية.
٢- تكثيف برامج التوعية والتثقيف البيئي التي ترفع من مستوى ثقافة الجمهور وتوعيته بأهمية المحافظة على البيئة وحمايتها من التلوث.
٣- إقامة المؤتمرات وحلقات العمل والندوات التدريبية، والمشاركة في المناسبات التي تتعلق بحماية البيئة والحد من التلوث على المستويات المحلية والعربية والعالمية.
٤- تبادل المعلومات والخبرات مع الجمعيات والهيئات المتخصصة، وإصدار النشرات الإرشادية ودعم الأبحاث البيئية ( المتعلقة بالبيئة البحرية).
٥- التنسيق مع الجهات العلمية ومراكز البحوث والدراسات والمؤسسات الوطنية لتشجيع البحوث البيئية