يتكون المركز من مجموعة من وحدات البحوث التي تغطي اهتماماته المختلفة وهي:
١- وحدة بحوث الجامعة والنشاط الأكاديمي.
٢- وحدة بحوث التنمية البشرية.
٣- وحدة بحوث المجتمع المصري.
٤- وحدة بحوث الأمن القومي.
٥- وحدة إدارة الصراع والأزمات.
٦- وحدة التدريب والتعليم المستمر.
٧- وحدة بحوث المرأة والسكان.
٨- وحدة بحوث رعاية الطلاب.
٩- وحدة بحوث المنظمات غير الحكومية.